Microbiële leefgemeenschappen vertegenwoordigen de grootste reservoirs van biodiversiteit op onze planeet en zijn van grote invloed op natuurlijke en door de mens gemaakte ecosystemen. Om deze enorme diversiteit te behouden en te benutten is fundamentele kennis over het functioneren van microbiële gemeenschappen en de intra- en interspecifieke interacties essentieel.
Het doel van de afdeling Microbiële Ecologie is het bestuderen van de ecologie, diversiteit, dynamiek en natuurlijke functies van micro-organismen in aquatische en terrrestrische ecosystemen. Hierbij zijn we nauw betrokken bij verscheidene NIOO-brede thema’s, in het bijzonder ‘chemical ecology’, ‘microbiomes’, ‘eco-evolutionary dynamics’ en ‘disease ecology’. De belangrijkste onderzoeksactiviteiten richten zich op: